L'Assemblée est l'autorité législative de l'EREJ. Cette dernière est composée de délégués issus des trois paroisses sises sur le territoire cantonal. Les sièges de l'Assemblée sont répartis en fonction du nombre de la taille des paroisses, respectivement:

• 13 délégués pour la paroisse de Delémont;
• 5 délégués pour la paroisse des Franches-Montagnes;
• 9 délégués pour la paroisse de Porrentruy;
• 5 délégués pour la paroisse de Moutier.

Jean-Louis WALTHER, Président de l'Assemblée, Courtedoux
Madeleine AMGWERD, Vice-présidente de l'Assemblée, Delémont
Jérémie CORTAT, Secrétaire de l'Assemblée, Glovelier
Mariette MONTAVON, Scrutatrice, Glovelier
Olivier LUDER, Scrutateur, Saignelégier
Henri SCHNEIDER, Scrutateur suppléant, Courgenay
Hans-Peter MATHYS, Scrutateur suppléant, Delémont